Muchas fuentes de proteína vegetal son deficientes en algún aminoácido, pero pueden ser combinadas para obtener fuentes vegetales de proteína completa. Por ejemplo la soja, y muchas legumbres, con niveles bajos de metionina, pero con buena cantidad de lisina, pueden ser combinadas con cereales como el arroz, el trigo o el maíz, que teniendo adecuados niveles de metionina, son escasos en lisina, para así obtener fuentes completas de proteína. En la actualidad se están introduciendo en el mercado diferentes fuentes de proteína vegetal prácticamente completas como la spirulina o la quinoa.